인간의 형태를 하고 사람들 속에 섞여, 인간 고기를 먹으며 살고 있는 ‘식종 구울’.

구울을 구축Ÿ연구하는CCG는 어떤 하나의 명제를 성취하기 위해 실험체 집단을 신설한다.

그것의 이름은 ‘크인크스’-.

제대로 된 인간이 아닌 그들과 함께, ‘사사키 하이세’ 일등 수사관이 ‘도쿄’의 한 마을에서 마주하게 되는 것은-!?

도쿄 구울 √A 그 2년 후의 이야기가 시작된다.