작고 평화로운 마을 트윈픽스에
테레사 뱅크스라는 금발 소녀의 시체가 강으로 떠내려 온 사건을 수사하기 위해
FBI 특별수사관 데스몬드와 샘이 파견된다.
그런 어느 날 2년 전 어느 소녀의 살인 사건을 수사하다 실종된
잔 FBI 수사요원 필립이 본부에 나타나
사건의 불길한 징조를 암시하고 유령처럼 사라진다.
때를 같이 해 수사관 데스몬드가 실종되었다는 소식이 날아든다.

1년 후 트윈픽스 마을에 사는 미의 여왕인 여고생 로라 팔머는
겉으로 보기엔 밝고 명랑한 소녀처럼 보이지만
12살때부터 실체를 알 수 없는 밥이라는 괴한에게 성폭행 당해온 자신을
학대하듯 마약과 혼음에 몸을 던지는 이중생활을 하고 있다.
로라는 어느날 자신의 일기장중 두 장이 찢겨나간 것을 발견하고
구체적으로 다가오는 밥의 실체를 느끼며 공포에 떤다.