어느날 집안에 다른 세계와 연결되어 있는 곳을 발견한 짱구네 가족.
그곳을 통해 그들 앞에 미래맨이 나타난다.
그는 3분 후에 괴물이 나타날 것이며
3분 후의 미래로 가서 그 괴물을 쓰러뜨리지 못하면 현실 세계에 실제로 괴물이 나타나게 된다고 말한다.
짱구와 가족들은 3분 안에 괴물을 물리쳐 지구를 구해야하는 운명에 처하게 되는데...